Först får vi räkna bort alla orter där det finns namn som Resecentrum och liknande.
Jag gjorde en snabb och enkel snabbtitt. Principen är denna:
För järnvägstrafiken: (inklusive eventuell regional/lokal dito) Ortnamnet C eller Ortnamnet Central eller Ortnamnet
För den lokala (buss/spv)trafiken: Centralstationen eller Centralen eller Järnvägsstationen eller Stationen
I några enstaka fall förekommer andra upplägg.
Det finns ingen anledning att Stockholm ska bryta detta mönster.
Stockholm Klara, Klara, City, T-Centralen, m.m. bryter detta mönster!

Slutligen måste jag säga att jag inte riktigt kan köpa argumentet att gemensamma namn skapar förvirring för larmnumret 112.
I så fall borde det inte kunna heta Fridhemsplan (T1,T3), Odenplan (T1,J), T-Centralen (T1+2,T3) Slussen (T1+2,SB).
Om detta är ett problem, sätt upp (om det inte redan finns) skyltar med unika spårnummer så borde det räcka.
------------------------------
Edit:
I Malmö finns en hållplatskarta (för i huvudsak bussar) och där kallas hållplatsen vid Malmö C för Malmö Central